＝＝＝＝＝周总结＝＝＝＝＝＝

这一周，感觉很紧张呀。
周一是节日，我去加班了，同Chao－gan一起。发现周末的时候办公室好像没有暖气，但也不冷。
周二的时候在NYU，Brown bag，post－doc meeting，Journal club。
周三的时候在NKI工作。
周四周五在CMI。 Typical。
周六在家里工作了一天。

这一周目标是NKI TRT数据处理完毕，然后做ICC map。结果没有完成。没有完成的原因是因为数据处理的Pipeline没有最终完成。
我主要做的工作是
1） 把所有的原始数据放到一个地方集中保管存放。使用script生成数据处理的目录结构，然后在合适得文件夹中使用soft link 链接到原始数据。这样就能保证数据与分析分开管理。
2）在IPN server上和gelert cluster上试验Sharad's的pipeline，把Sharad叫到我身边一起工作了两天，基本上script可以使用了。但是gelert却down了！ 我多数数据都在上面。希望周一的时候它能活过来。
3）按照Jennifer的要求做了几个图。她在做paper的revision
4）给Melanie做了 inter－rator reliability的分析。结果她给我得数据有误。周四得时候给了我新的数据，但我到现在都没有时间来进行再次处理。
5）跟UMN 的Steen Moeller 往来通信，试图解决Matlab recon的问题。到现在位置得到三次code得update。希望这次之后就一起OK了。
6）跟 Junqiang, Gordon, Wang 和NKI得 Dr Matt Hotpman取得联系，问了DTI相关的问题。Matt指出我的DTI处理结果看上去有问题。Gordon给了个解决方案，还没有试验。
7）Deface 了一些Anat MRI数据，交给了 Dr. Arno Klein。
周六也工作了一天。好累。明天好好休息。神马也不做！

青青穿了汉服去上课，回来给我发了照片。不错

娱乐，基本上没有做什么。接着读《unbroken》这书好长，这都好几个星期了，我读了一半都不到。
锻炼了一次。
健康：
这周睡得都很晚，有三次3 am才睡，8点就起床了。

朋友：
Lingxi和Nic快要来NYC啦。


然后，今年很有可能我有生以来第一次一个人过春节吧。
春节快乐！
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这一周总的感觉是累。很多事情都没有能安排好。整天疲惫，脸上又起包了。苦逼的一周。
需要时间来重新来校正一下自己。要开始锻炼 并且track自己每天的工作时间！
这周是OHBM的abstract deadline。我没有提交任何东西。Chao-Gan, Brian 和 Lingxi 提交的abstracts 把我列为了co-author


工作：
看了一下自己上周的工作计划，完成度在80％左右。
1 DTI 数据
全部用recon处理了一遍，36个文件中17个失败。
剩下的数据，已经生成了FA maps，下一步是要把他们进行空间对准，然后是ICC map。目前进度是空间对准又问题。
2 Sharad‘s Pipeline
 对比了fcon bash script和Sharad's pipeline, 结果一致。
 顺便升级了自己改编的那个bash scipt到最新版本，可以使用非线性对准。
3 得到了更多的REST_CAP 数据，需要进一步处理，然后生成ICC map，mike
4 拿到了一些REST_645 和REST_1400的数据，下一周要开始处理他们，需要弄一个data repository
5 开始recon eye movement 数据
6 给了Josh 安装软件的code。下一步需要处理DTI数据，使用nipype
7 修改了paper，交给了J，有两个比较难的问题我不知道怎么回答。


其他需要做的：
why DTI recon fail？
why 4022_2's eyemovement_645 data look odd?
这一写总结，把下周要做的事情的大概也整理出来了。不错。
找到UG07的原始数据，plot histogram， 确定是否有express saccade


阅读: 接着读《unbroken》


其他：
回家的路上遇到两个艺人在N车上表演。一个base一个吉他，各有一个音箱。不记得他们时在哪一站上的，估计是在Union Square。反正他们一直在我们的车厢弹，弹了得有7，8站，至少半小时。我本来说自己不要在地铁上随便给人钱了，可是他们弹了一曲超级马力，立即就把我征服了。一路上他们还弹了The Beatles 和Michael Jackson，还有许多好听的歌。一周一来的stress就这样，被两个街头艺人大约半个小时的表演，一扫而空了！


看了机票，计划下周二三买票，2月份飞去NC看mm。


加油！
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从今天起，周总结要写得简短些。


工作
本周的focus是 NKI TRT数据。
Data processed by Sharad's pipeline，modified fcon_1000 bash scripts. ICC maps generated to assess inter-session reliability for ALFF, fALFF, RSFC maps (seeds: PCC MT MPF FEF IPS and...)
DTI data are being reconstructed. will gen FA maps and ICC maps for FA.
 Touble-shooting Sharad's pipeline

学习
DTI preprocessing

阅读
<Unbroken>

Others
Hongying went back to China. Chao-gan, Xiaomeng, Qingqing and I went to Flushing to give him a farewell party.
Qing went back to NC. School starts next week. [继续阅读或评论...]